福建物质结构研究所测试中心成立于2001年3月份，测试中心的总体目标是建立共享测试仪器资源和对外开放服务机制、对仪器资源进行有效的开发利用，为我所的基础研究、应用基础研究、应用研究到成果转化提供有力的支撑服务。

中心的大型仪器设备由具有实践经验的专门技术人员管理操作，在保证工作正常开展的同时中心正在逐步实行“一专多能”的管理模式，同时中心组织一批仪器设备组建了开放仪器实验室向科研人员开放：由培训合格的科研人员直接进行仪器操作，中心只负责这些仪器的日常管理维护及科研人员的培训工作。

2009年中心对现有仪器设备进行了分类，组建了结构分析中心和性能检测中心，其中结构分析中心主要进行化合物/材料的表面结构、分子/原子结构、晶体结构的分析；性能检测中心可以进行材料的光、电、磁、热性能等参数的分析测试。